Städte wie London und New York haben ihre eigenen einzigartigen Mikrobiome

Durch

Die Skyline von Tokio, Japan

Sara Winter / Alamy

Jede Stadt hat ihr eigenes Mikrobiom. Dies geht aus einer umfassenden Untersuchung von Mikroben in 60 städtischen Gebieten weltweit hervor, bei der auch 11.000 neue Viren und Bakterien entdeckt wurden.

Christopher Mason von der Cornell University in New York und sein Team baten Kollegen auf der ganzen Welt, zwischen 2015 und 2017 Tupfer aus städtischen Verkehrssystemen wie U-Bahnen zu sammeln. Insgesamt wurden 4728 Proben aus Städten wie London, New York und Rio de gesammelt Janeiro und Tokio. Rund 58 Prozent der Städte befanden sich in Ostasien und Europa.

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Die Nylonabstriche, die in ein Röhrchen gegeben wurden, das ein DNA- und RNA-Konservierungsmittel enthielt, wurden dann genetisch analysiert, um festzustellen, welche Arten von Bakterien und Viren auf den Oberflächen vorhanden waren. „Ich fahre jeden Tag mit der U-Bahn zum Labor, deshalb wollte ich wissen, was ich unter meinen Händen packte“, sagt Mason.

Von dort aus wurde jeder Stadt ein Endemizitätswert zugewiesen – die Anzahl der in einem bestimmten Gebiet endemischen mikrobiellen Arten, die den eindeutigen Fingerabdruck jeder Stadt definieren können.

Je größer die Stadt, desto komplexer und vielfältiger das mikrobielle Leben. Und in jeder Stadt, unabhängig von ihrer Größe, war jeder Kilometer Abstand zwischen zwei Proben im Durchschnitt mit einem Unterschied von 0,056 Prozent bei den untersuchten Mikroben verbunden.

„Wir konnten wahrscheinlich mit einer Genauigkeit von 90 Prozent feststellen, woher jemand kam, und diese Daten werden besser, wenn wir mehr Stichproben machen“, sagt Mason.

Dies deutet darauf hin, dass die Mikrobiome Anwendungen in forensischen Untersuchungen haben könnten, um möglicherweise festzustellen, ob eine Person in der jüngeren Vergangenheit eine bestimmte Stadt besucht hat.

Mason und sein Team entdeckten 10.928 neue Viren und 748 neue Bakterien, die in keiner Referenzdatenbank vorhanden waren. “Ich war überrascht, wie viele es gab”, sagt er. “Ich denke, es ist eine wunderbare Bestätigung dafür, wie viel wir noch über die Welt entdecken müssen.”

Das Team plant, die Probenahme von Oberflächen auf Abwasser auszudehnen, und beabsichtigt, Proben von den bevorstehenden Olympischen Spielen in Tokio zu analysieren – sofern diese durchgeführt werden. Die Hoffnung besteht darin, die Ergebnisse in Datenbanken für die öffentliche Gesundheit zu integrieren, um neue Viren aufzuspüren.

Zeitschriftenreferenz: Zelle, DOI: 10.1016 / j.cell.2021.05.002

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